AGA の最も大きな原因は、男性ホルモンによる影響です。体内中のテストステロンと呼ばれる男性ホルモンが、5αリダクターゼという変換酵素の働きにより、ジヒドロテストステロンというホルモンに変換され、これが毛乳頭細胞に存在する受容体と結合すると、髪の成長を抑制してしまうといわれております。

また、これに起因して正常なヘアサイクル（成長期・退行期・休止期）が乱れ、通常２〜5年程度の成長期の期間が短縮し十分に成長しきれないまま退行期に誘導されるので細くて柔らかい髪(軟毛)が目立つようになり結果として薄毛となってしまいます。つまり、AGAは、ヘアサイクルが崩れることにより起こる症状といえます。

また、AGAは先天的遺伝によるところが大きいと言われておりますが、「食生活」「睡眠」「喫煙」「生活習慣」「ストレス」など後天的な要素も進行させる原因だとも考えられています。